More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3234 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3234  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 257 aa  501  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.458923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2587  short chain dehydrogenase  98.05 
 
 		 257 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  77.87 
 
 		 254 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  68.4 
 
 		 254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  68.4 
 
 		 254 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  68 
 
 		 254 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  66.8 
 
 		 254 aa  316  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  66.8 
 
 		 254 aa  315  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  64.54 
 
 		 255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  64.8 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4456  short chain dehydrogenase  67.58 
 
 		 258 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.968852  decreased coverage  0.00124263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  66.14 
 
 		 255 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  63.2 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  64.29 
 
 		 255 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  64.68 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3492  short chain dehydrogenase  62.2 
 
 		 256 aa  285  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  57.96 
 
 		 249 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  54.18 
 
 		 252 aa  255  5e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  55.2 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1734  short chain dehydrogenase  52.85 
 
 		 249 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747593  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0751  short chain dehydrogenase  56.7 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450614  normal  0.482949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2039  short chain dehydrogenase  56.25 
 
 		 250 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 		 267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 		 257 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 		 248 aa  181  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 261 aa  180  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  40.74 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 		 250 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  41.43 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  41.83 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  41.29 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  39.68 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.64 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  43.82 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.849975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  42 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  41.6 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0536617  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  40.96 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 		 256 aa  158  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.19 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 251 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.259784  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 259 aa  156  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  39.2 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.11 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.96 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  40.56 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 269 aa  155  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.255418  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 248 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0136754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000391653  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00696289  normal  0.955731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  41.09 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.838313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>