More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4356 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 254 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  89.37 
 
 		 254 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  61.66 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  61.26 
 
 		 254 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  61.26 
 
 		 254 aa  301  9e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  61.66 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  61.26 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  58.59 
 
 		 255 aa  291  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  59.38 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  59.22 
 
 		 255 aa  279  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3234  short chain dehydrogenase  63.2 
 
 		 257 aa  279  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.458923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  59.22 
 
 		 255 aa  278  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4456  short chain dehydrogenase  56.75 
 
 		 258 aa  268  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.968852  decreased coverage  0.00124263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  55.12 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2587  short chain dehydrogenase  63.2 
 
 		 257 aa  265  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3492  short chain dehydrogenase  57.25 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  50.79 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  53.63 
 
 		 249 aa  238  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  50.6 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1734  short chain dehydrogenase  47.58 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747593  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0751  short chain dehydrogenase  49.78 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450614  normal  0.482949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2039  short chain dehydrogenase  49.33 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 		 252 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  43.9 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  45.1 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 		 248 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  41.13 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  41.13 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  44.03 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.23 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 		 249 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.23 
 
 		 246 aa  174  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 250 aa  171  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.96 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  41.98 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  41.22 
 
 		 253 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.259784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  42.13 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.06 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 		 267 aa  165  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.92 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  41.15 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0136754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  39.6 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  39.2 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790867  normal  0.270985 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  39.13 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0264  putative short-chain dehydrogenase  38.93 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.16 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.6 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.55 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  38.34 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  38.34 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  38.34 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.372057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.65 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  38.4 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  38.34 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  43.92 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>