More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5327 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0136754  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  92.74 
 
 
248 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0264  putative short-chain dehydrogenase  66.39 
 
 
262 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.25 
 
 
249 aa  300  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790867  normal  0.270985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  60.89 
 
 
274 aa  295  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0720968  normal  0.127644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1600  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.32 
 
 
248 aa  294  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.73 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.23 
 
 
250 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.23 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
248 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219217  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2964  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  43.5 
 
 
248 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.95662  hitchhiker  0.0000180421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2523  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  43.5 
 
 
248 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  47.37 
 
 
249 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  45.12 
 
 
255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  45.97 
 
 
251 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 
252 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  46.37 
 
 
253 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 
252 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  42.62 
 
 
256 aa  198  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  45.16 
 
 
253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
253 aa  195  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
252 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  44.35 
 
 
253 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  43.95 
 
 
253 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
253 aa  189  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  43.55 
 
 
253 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  41.53 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
256 aa  182  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
248 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.849975  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.64 
 
 
255 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
270 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.309971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
252 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
257 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 
267 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
258 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
255 aa  175  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
269 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.255418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
251 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  44.76 
 
 
253 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
259 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.39 
 
 
245 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.55 
 
 
249 aa  168  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.94 
 
 
247 aa  168  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
253 aa  168  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.91 
 
 
247 aa  168  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
260 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000468902  normal  0.0104317 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3027  Short-chain dehydrogenase/reductase  42.23 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.730472  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02320  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.278607  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  40.65 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.55 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 
254 aa  162  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
280 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
251 aa  161  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0607199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
253 aa  161  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  40.08 
 
 
255 aa  160  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
280 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
250 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  41.3 
 
 
257 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.78 
 
 
246 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
253 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2283  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  44.44 
 
 
251 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.890359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
263 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000760103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.62 
 
 
247 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
253 aa  159  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 
254 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
256 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
261 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
253 aa  159  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
252 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
252 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.25 
 
 
246 aa  158  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
252 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.352293  normal  0.915226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
255 aa  158  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
252 aa  158  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
255 aa  158  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.259784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
265 aa  158  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
250 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
251 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
280 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.18 
 
 
248 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  40 
 
 
246 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  37.15 
 
 
272 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  37.15 
 
 
272 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.66 
 
 
245 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.74 
 
 
272 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
251 aa  156  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.76 
 
 
250 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
255 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>