More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0642 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
252 aa  511  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
252 aa  224  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3961  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985096  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  43.31 
 
 
257 aa  205  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
244 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
257 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 
248 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
251 aa  203  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
251 aa  203  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.29 
 
 
251 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000407954 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
254 aa  202  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
283 aa  202  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  45.14 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
258 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 
247 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.83 
 
 
244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509935 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.83 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
250 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.02 
 
 
253 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.199274  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
254 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
254 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699646  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  43.48 
 
 
255 aa  195  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 
247 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 
250 aa  195  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0497593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
250 aa  194  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.48 
 
 
250 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.9 
 
 
252 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
254 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572061  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
244 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.5 
 
 
252 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0620  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 
254 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
251 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
265 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
251 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
254 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3550  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.22 
 
 
244 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652114  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
254 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
244 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
260 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
257 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.560297 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
246 aa  188  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.86578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.94 
 
 
252 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2279  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.94 
 
 
252 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0734  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.94 
 
 
252 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3005  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.94 
 
 
252 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1076  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.94 
 
 
252 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1082  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.94 
 
 
252 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1234  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.55 
 
 
252 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
250 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
257 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  41.27 
 
 
253 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
248 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
256 aa  185  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0876  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.37 
 
 
252 aa  185  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
247 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  0.690842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  40.48 
 
 
253 aa  184  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
282 aa  184  9e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
256 aa  184  9e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  40.64 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3402  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.5 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615434  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2464  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.73 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1094  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.73 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742877  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.71 
 
 
252 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
244 aa  182  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.372052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
257 aa  183  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759988  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.14 
 
 
244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.117254  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.14 
 
 
244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.550186  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
244 aa  182  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248002  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
261 aa  181  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0777  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.39 
 
 
249 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
260 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 
246 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2175  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.23 
 
 
252 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274234  hitchhiker  0.0000363255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
254 aa  180  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
250 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2329  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.94 
 
 
252 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5746  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.94 
 
 
252 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00520623  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1699  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  40.93 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2412  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  40.93 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1604  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.31 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.335692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
251 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
259 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0727  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.39 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  38.98 
 
 
254 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03264  dehydrogenase/reductase SDR family member 6  42.86 
 
 
256 aa  178  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  42.52 
 
 
255 aa  178  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.9 
 
 
246 aa  178  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0174  short-chain dehydrogenase  43.87 
 
 
246 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.61 
 
 
249 aa  178  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>