More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1738 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.86578  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.73 
 
 		 244 aa  317  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.372052 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.49 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.08 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.97 
 
 		 247 aa  310  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.78 
 
 		 254 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.78 
 
 		 254 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699646  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.2 
 
 		 246 aa  308  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1699  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  62.2 
 
 		 246 aa  308  8e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2412  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  62.2 
 
 		 246 aa  308  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.79 
 
 		 246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.368584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.75 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000407954 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  63.56 
 
 		 247 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.78 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0620  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.99 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.2 
 
 		 254 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.45 
 
 		 244 aa  300  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.42 
 
 		 254 aa  299  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.2 
 
 		 254 aa  291  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1604  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  61.94 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.43 
 
 		 247 aa  285  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.7 
 
 		 252 aa  284  8e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.6 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03264  dehydrogenase/reductase SDR family member 6  56.63 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2375  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  62.35 
 
 		 247 aa  281  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.388212  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1159  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  62.35 
 
 		 247 aa  281  9e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.43 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1082  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  61.94 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.175949  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0642  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  61.94 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1785  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  61.94 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0823  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  61.94 
 
 		 247 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.87 
 
 		 244 aa  274  8e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248002  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.97 
 
 		 248 aa  271  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.15 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 		 244 aa  265  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742877  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.28 
 
 		 247 aa  262  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  0.690842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.06 
 
 		 261 aa  261  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3961  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.28 
 
 		 243 aa  258  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.1 
 
 		 244 aa  258  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.26 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.550186  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.26 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.117254  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.96 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3876  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.6 
 
 		 266 aa  256  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.47 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509935 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.16 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525442  normal  0.830856 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.76 
 
 		 244 aa  254  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.10023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.88 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0174  short-chain dehydrogenase  55.87 
 
 		 246 aa  251  7e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.47 
 
 		 246 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.335692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.07 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.199274  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.79 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.639156 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5692  oxidoreductase  52.03 
 
 		 244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.38 
 
 		 250 aa  244  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0497593 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3889  Short-chain dehydrogenase/reductase  55.79 
 
 		 236 aa  244  9e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.521289  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.1 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.79 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3550  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.44 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3256  malate/L-lactate dehydrogenase  49.59 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0180309  normal  0.2268 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 		 252 aa  201  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759988  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 252 aa  165  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 258 aa  164  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1175  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.6 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267366  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.25 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 263 aa  161  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.17 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000715788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  40.55 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.47 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 263 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  40.16 
 
 		 263 aa  158  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.47 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  39.45 
 
 		 269 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  37.84 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1409  aldose dehydrogenase  36.95 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  35.25 
 
 		 257 aa  151  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 		 259 aa  151  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>