More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2106 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
244 aa  487  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248002  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.98 
 
 
252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.22 
 
 
244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0620  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.02 
 
 
254 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.42 
 
 
254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.81 
 
 
254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_004310  BR0243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  62.55 
 
 
244 aa  301  6.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.550186  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  62.55 
 
 
244 aa  301  6.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.117254  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.94 
 
 
247 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.84 
 
 
254 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.84 
 
 
254 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699646  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.02 
 
 
247 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  0.690842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.57 
 
 
244 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509935 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.26 
 
 
246 aa  295  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.335692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0174  short-chain dehydrogenase  66.26 
 
 
246 aa  295  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.24 
 
 
247 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.49 
 
 
246 aa  293  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.84 
 
 
254 aa  292  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572061  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.06 
 
 
251 aa  292  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000407954 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  60.48 
 
 
247 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61 
 
 
244 aa  289  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 
244 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.98 
 
 
244 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.10023 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.02 
 
 
254 aa  284  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428545  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.16 
 
 
244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525442  normal  0.830856 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.85 
 
 
244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.26 
 
 
244 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.83 
 
 
242 aa  281  9e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.2 
 
 
261 aa  279  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.34 
 
 
244 aa  275  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1699  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  58.47 
 
 
246 aa  275  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.47 
 
 
246 aa  275  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2412  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  58.47 
 
 
246 aa  275  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5692  oxidoreductase  55.6 
 
 
244 aa  275  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 
244 aa  274  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1604  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.7 
 
 
247 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3961  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.92 
 
 
243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985096  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.63 
 
 
250 aa  271  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0497593 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2375  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.3 
 
 
247 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.388212  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1159  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.3 
 
 
247 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.32 
 
 
248 aa  268  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.4 
 
 
246 aa  268  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.368584  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.06 
 
 
250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.13 
 
 
248 aa  268  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1082  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.49 
 
 
247 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.175949  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0642  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.89 
 
 
247 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1785  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.89 
 
 
247 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0823  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.89 
 
 
247 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03264  dehydrogenase/reductase SDR family member 6  54.69 
 
 
256 aa  263  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.47 
 
 
246 aa  261  6.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.86578  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.07 
 
 
247 aa  257  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.88 
 
 
244 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.372052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3550  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.02 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652114  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.85 
 
 
253 aa  251  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.199274  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.18 
 
 
250 aa  251  7e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3876  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.69 
 
 
266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3256  malate/L-lactate dehydrogenase  50.62 
 
 
247 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0180309  normal  0.2268 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.17 
 
 
236 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.639156 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3889  Short-chain dehydrogenase/reductase  54.58 
 
 
236 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.521289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
252 aa  182  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
252 aa  165  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.8 
 
 
246 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
254 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
246 aa  158  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
251 aa  155  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.1 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
250 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
263 aa  151  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
263 aa  151  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
263 aa  151  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
263 aa  151  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
263 aa  151  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 
263 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 
263 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
253 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0299033  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
258 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 
263 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  37.05 
 
 
263 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 
263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 
263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 
263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 
263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  35.6 
 
 
263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
251 aa  145  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  41.74 
 
 
248 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
251 aa  145  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
251 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
249 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
263 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  34.13 
 
 
257 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
254 aa  142  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
253 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
255 aa  141  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1400  short chain dehydrogenase  36.11 
 
 
264 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.473326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>