More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2351 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 
252 aa  511  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  90.08 
 
 
252 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  89.68 
 
 
252 aa  470  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0675  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  78.88 
 
 
253 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.228459  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3005  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.43 
 
 
252 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0734  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.43 
 
 
252 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2616  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  75.79 
 
 
252 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1234  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.83 
 
 
252 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1076  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.43 
 
 
252 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.43 
 
 
252 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2279  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.43 
 
 
252 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1082  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.03 
 
 
252 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0876  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.83 
 
 
252 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2175  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  73.41 
 
 
252 aa  363  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274234  hitchhiker  0.0000363255 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2464  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  72.22 
 
 
252 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3402  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  72.22 
 
 
252 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615434  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1094  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.83 
 
 
252 aa  358  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5746  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.43 
 
 
252 aa  357  9e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00520623  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1807  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.83 
 
 
252 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2419  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.83 
 
 
252 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0453147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2329  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.83 
 
 
252 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2423  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.83 
 
 
252 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.334862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0873  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  71.43 
 
 
252 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0691884  normal  0.680031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3005  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  60.47 
 
 
253 aa  311  9e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1358  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  63.1 
 
 
255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2289  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  60.87 
 
 
253 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  59.13 
 
 
247 aa  293  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4884  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  61.69 
 
 
261 aa  292  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.636092  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1429  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.17 
 
 
256 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.865814 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0092  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  60.16 
 
 
253 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2660  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  61.72 
 
 
256 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00127593  normal  0.0689416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  62.3 
 
 
249 aa  284  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2853  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.4 
 
 
249 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01763  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_6G09140)  55.16 
 
 
257 aa  280  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.134641  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4948  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.8 
 
 
250 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3586  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  60.47 
 
 
253 aa  278  8e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108219  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1050  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  61.11 
 
 
249 aa  271  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  53.17 
 
 
251 aa  269  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0774  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.54 
 
 
246 aa  265  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.448664  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2891  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  59.13 
 
 
242 aa  260  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000353377  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1252  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.71 
 
 
248 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0173112 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.81 
 
 
249 aa  238  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0777  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.01 
 
 
249 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0727  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.61 
 
 
249 aa  229  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1287  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.47 
 
 
252 aa  228  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1013  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.47 
 
 
252 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.08 
 
 
252 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
250 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.77 
 
 
255 aa  185  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
252 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  42.46 
 
 
257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
251 aa  178  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
256 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
260 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
252 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
252 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  40 
 
 
253 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
246 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
251 aa  175  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
246 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09284  conserved hypothetical protein  39.15 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00149371  normal  0.454861 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
257 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 
249 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
252 aa  171  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
250 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0940  putative short-chain dehydrogenase  39.85 
 
 
266 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
252 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
255 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2879  putative alcohol dehydrogenase, zinc-independent  39.23 
 
 
265 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.575303  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
255 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
252 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  40 
 
 
253 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 
253 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
254 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
258 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.8 
 
 
246 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 
253 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.8 
 
 
246 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.8 
 
 
246 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
256 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
257 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
265 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000369604  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  40 
 
 
253 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  36.51 
 
 
250 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
252 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  37.3 
 
 
247 aa  167  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
253 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_642  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  37.79 
 
 
265 aa  166  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100952  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
257 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.8 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
251 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
251 aa  166  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
251 aa  166  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
282 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
256 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
249 aa  165  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>