More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6011 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 248 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.94 
 
 		 248 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.16 
 
 		 247 aa  355  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.15 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.35 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.15 
 
 		 244 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.59 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.76 
 
 		 251 aa  298  6e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000407954 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.22 
 
 		 247 aa  289  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  55.82 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.28 
 
 		 247 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.96 
 
 		 244 aa  284  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.22 
 
 		 252 aa  284  9e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1604  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.83 
 
 		 247 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.16 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1082  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.47 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.175949  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2375  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.47 
 
 		 247 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.388212  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1159  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.47 
 
 		 247 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.75 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.75 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699646  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1785  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.47 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0642  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.47 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0823  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.47 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0620  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 		 254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.32 
 
 		 244 aa  268  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248002  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.35 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.35 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.75 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  56.18 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.550186  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.23 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2412  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  51.23 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  56.18 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.117254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1699  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  51.23 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 244 aa  261  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.372052 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.89 
 
 		 247 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  0.690842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.23 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.368584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3256  malate/L-lactate dehydrogenase  57.54 
 
 		 247 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0180309  normal  0.2268 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.63 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.335692 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.79 
 
 		 246 aa  258  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.97 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.86578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03264  dehydrogenase/reductase SDR family member 6  52.82 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0174  short-chain dehydrogenase  58.23 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3550  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  59.36 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.652114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.17 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.639156 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3889  Short-chain dehydrogenase/reductase  59.75 
 
 		 236 aa  254  7e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.521289  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.76 
 
 		 254 aa  254  9e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3961  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.42 
 
 		 243 aa  251  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.42 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3876  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.22 
 
 		 266 aa  250  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.97 
 
 		 250 aa  248  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0497593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 		 244 aa  244  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 		 244 aa  245  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.41 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.199274  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 		 244 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.10023 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 		 244 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.525442  normal  0.830856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.69 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5692  oxidoreductase  50.2 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 		 259 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1400  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.473326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 263 aa  151  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 269 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  35.52 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1817  short chain dehydrogenase  37.26 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 		 259 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1871  short chain dehydrogenase  36.88 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  40.31 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.3 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  39.46 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  39.69 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  39.46 
 
 		 260 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  39.46 
 
 		 260 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759988  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  41 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.3 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  38.28 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>