More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0515 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
249 aa  494  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.11 
 
 
262 aa  322  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.98 
 
 
246 aa  308  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.89 
 
 
245 aa  283  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.28 
 
 
262 aa  275  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.7 
 
 
245 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.58 
 
 
250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
250 aa  207  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.41 
 
 
257 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 
249 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
257 aa  205  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
255 aa  202  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 
256 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 
252 aa  201  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  47.64 
 
 
257 aa  198  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 
256 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.62 
 
 
256 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.75 
 
 
253 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 
254 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
252 aa  192  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
265 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
251 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
258 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
244 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.9 
 
 
283 aa  189  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.8 
 
 
249 aa  188  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
252 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
252 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.39 
 
 
252 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0777  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44 
 
 
249 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
251 aa  186  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  42.04 
 
 
256 aa  185  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  43.72 
 
 
251 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
250 aa  185  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
251 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
251 aa  183  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  42.57 
 
 
253 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1466  short-chain alcohol dehydrogenase  44.14 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137862  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0727  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.6 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 
261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  42.17 
 
 
253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
258 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  41.77 
 
 
253 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
258 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
256 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  42.13 
 
 
247 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  44.8 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  41.77 
 
 
253 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  42.06 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  45.88 
 
 
255 aa  178  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  41.34 
 
 
247 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
251 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.23 
 
 
247 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 
255 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162923  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
267 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 
267 aa  176  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  43.08 
 
 
259 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
248 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
252 aa  176  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.56 
 
 
246 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  42.11 
 
 
261 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  42 
 
 
253 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11085  conserved hypothetical protein  41.29 
 
 
271 aa  175  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
282 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
280 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
269 aa  175  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.255418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
280 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 
287 aa  174  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38962  normal  0.0399907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  44.8 
 
 
254 aa  174  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
251 aa  174  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.372057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.89 
 
 
244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2853  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.27 
 
 
249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3027  Short-chain dehydrogenase/reductase  41.8 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.730472  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  42.63 
 
 
257 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
259 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
251 aa  171  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.6 
 
 
239 aa  171  6.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.18 
 
 
251 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>