More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0514 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
252 aa  504  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75 
 
 
251 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 
250 aa  218  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 
257 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 
251 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
251 aa  199  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
251 aa  199  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
246 aa  198  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.6 
 
 
246 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
246 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
256 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 
256 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.2 
 
 
246 aa  192  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  40.64 
 
 
255 aa  192  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
252 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  41.7 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
252 aa  189  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  43.08 
 
 
253 aa  188  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
253 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.9 
 
 
246 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.8 
 
 
246 aa  187  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
266 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.9 
 
 
246 aa  186  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
250 aa  184  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
283 aa  184  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  41.34 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.06 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.388787  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
252 aa  182  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
252 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 
249 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
255 aa  180  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.259784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
253 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
258 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.65 
 
 
239 aa  178  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 
253 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
251 aa  178  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
246 aa  178  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 
253 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
254 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  42.63 
 
 
253 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.8 
 
 
252 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
249 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790867  normal  0.270985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
244 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  39.06 
 
 
257 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
258 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
265 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  41.8 
 
 
253 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 
253 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.7 
 
 
250 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.2 
 
 
252 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
252 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
244 aa  175  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 
259 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.27 
 
 
247 aa  175  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 
269 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
251 aa  175  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 
269 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
246 aa  175  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
251 aa  175  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 
259 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 
259 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 
259 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 
259 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
261 aa  175  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.36 
 
 
245 aa  174  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.83 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  42.02 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.15 
 
 
265 aa  172  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  42.13 
 
 
258 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
244 aa  172  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2110  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.87 
 
 
246 aa  171  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
247 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 
258 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
242 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0353846 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
254 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933062  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
255 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
254 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
254 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699646  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 
259 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
254 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0620  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
254 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  41.94 
 
 
255 aa  170  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.55 
 
 
255 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
257 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>