More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2297 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
267 aa  525  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.96 
 
 
247 aa  251  9.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
254 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 
259 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 
256 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.438607  normal  0.336746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 
256 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285018  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
272 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
265 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  44.53 
 
 
254 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 
264 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314701  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
257 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
251 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
260 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
254 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1618  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  40.24 
 
 
255 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.455189  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  36.72 
 
 
266 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1561  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  40.24 
 
 
255 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1914  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  41.13 
 
 
240 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
256 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
276 aa  148  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
254 aa  148  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.487626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
255 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
254 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
254 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  41.46 
 
 
260 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
254 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
254 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
251 aa  145  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0468  gluconate 5-dehydrogenase  39.84 
 
 
251 aa  145  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
258 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
249 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
249 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
250 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  38.49 
 
 
251 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.37 
 
 
249 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
255 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
254 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 
249 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 
248 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
257 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.41 
 
 
253 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1010  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.41 
 
 
253 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.88 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.485877  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19640  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  43.55 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2747  gluconate 5-dehydrogenase  41.46 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465274  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6224  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
255 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000552131  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  34.68 
 
 
257 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
254 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
258 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  35.92 
 
 
255 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  35.74 
 
 
256 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1505  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.18 
 
 
244 aa  139  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0160485  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  39.84 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  34.69 
 
 
261 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
248 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
248 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
258 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  38.96 
 
 
255 aa  138  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
266 aa  139  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.388787  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 
249 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179495  normal  0.922727 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
248 aa  138  7.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.4 
 
 
251 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
248 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  34.78 
 
 
258 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04045  tropinone reductase  38.22 
 
 
258 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
255 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
255 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0149136  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  32.8 
 
 
254 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
254 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
251 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.893367  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
255 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
255 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
255 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
264 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5878  gluconate 5-dehydrogenase  40.54 
 
 
259 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.854497  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
257 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
251 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4255  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  41.63 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.337254  normal  0.605714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2017  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.84 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0115083  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>