More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4739 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 245 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.98 
 
 		 245 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.98 
 
 		 245 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.73 
 
 		 205 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.11 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  40.76 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 234 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  39.57 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  32.78 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  38.63 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 		 240 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  39.66 
 
 		 237 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 204 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  32.05 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  36.13 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 		 236 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  30.08 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  30.08 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 		 246 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.64 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 241 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170214  normal  0.189904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.13 
 
 		 251 aa  95.9  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  36.31 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  36.31 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 		 246 aa  92  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 249 aa  92  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3253  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.89 
 
 		 250 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.152872  normal  0.595682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 249 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 		 258 aa  89.4  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 		 256 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145372 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  31.92 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3892  putative oxidoreductase  33.88 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.300054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.268207  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 		 259 aa  85.9  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1421  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.27 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>