More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3460 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 245 aa  493  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  43.08 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 		 255 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0696546 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.04 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201856  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 253 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 		 255 aa  184  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  43.92 
 
 		 261 aa  182  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 249 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  42.86 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 		 245 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0875  short chain dehydrogenase  41.25 
 
 		 259 aa  178  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0875261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 252 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3121  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1576  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.8 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  43.15 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3532  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2292  short chain dehydrogenase  40.87 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0242  Short-chain alcohol dehydrogenase  39.37 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 		 253 aa  165  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 251 aa  165  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3706  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  42.47 
 
 		 282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0524  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3720  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0906259  normal  0.2081 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 		 246 aa  162  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4559  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5530  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 262 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3804  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0373  Short-chain alcohol dehydrogenase  39.02 
 
 		 243 aa  161  8.000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.545921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2249  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113674  decreased coverage  1.89116e-19 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  39.37 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0283  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 259 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.879782  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2649  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 259 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1627  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 259 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.57 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0246  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 265 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0943  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 265 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1430  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 265 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.49 
 
 		 239 aa  158  9e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2217  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0671  putative short-chain dehydrogenase/reductase  42.13 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2511  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 267 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  40.39 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3961  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>