More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1079 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
237 aa  470  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 
238 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  40.85 
 
 
245 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  39.74 
 
 
245 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  37.87 
 
 
237 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
237 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
234 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  37.87 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  37.87 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  37.87 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 
204 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
240 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
237 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 
236 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 
240 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 
240 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 
240 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 
240 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
238 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
237 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  34.03 
 
 
270 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
239 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 
240 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  45.19 
 
 
245 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  34.33 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  44.17 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 
248 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 
246 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  34.03 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  31.49 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  43.51 
 
 
250 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
259 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
245 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
245 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
238 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  30.64 
 
 
238 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
241 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
245 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  28.81 
 
 
242 aa  102  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
248 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
246 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
249 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
244 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3946  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
289 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  31.17 
 
 
245 aa  96.3  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.75 
 
 
245 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0027  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.17 
 
 
245 aa  95.1  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
258 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
274 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16710  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.18 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
254 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
231 aa  92.8  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.268207  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.61 
 
 
238 aa  92.4  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 
256 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 
256 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
280 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3534  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase  29.92 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.57 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
272 aa  88.2  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 
258 aa  88.2  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26730  putative short-chain dehydrogenase  29.75 
 
 
292 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
251 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
280 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
245 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
249 aa  85.9  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2267  putative short-chain dehydrogenase  29.34 
 
 
292 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2377  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 
273 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
254 aa  85.5  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.8 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
248 aa  85.1  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
255 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.27 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0149136  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.49 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.49 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206772  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3393  2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase  28.17 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.453301 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4637  short chain dehydrogenase  29.07 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0597104  normal  0.0798604 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4505  short chain dehydrogenase  29.07 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15196  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>