More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2533 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 243 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  44.94 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  42.98 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5080  short chain dehydrogenase  46.28 
 
 		 240 aa  181  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  41.49 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  49.19 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  49.55 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  49.19 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 		 241 aa  151  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 246 aa  151  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  38.75 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  33.47 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  37.24 
 
 		 270 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  38.56 
 
 		 237 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  37.24 
 
 		 240 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  37.24 
 
 		 240 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  37.24 
 
 		 240 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  37.24 
 
 		 240 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 240 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  37.66 
 
 		 240 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 		 259 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  39.41 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  32.22 
 
 		 222 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.06 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  38.92 
 
 		 204 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.21 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0696  glucose 1-dehydrogenase  32.92 
 
 		 252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00331942  hitchhiker  0.00525068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03085  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  33.47 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3414  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 248 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 		 237 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3892  putative oxidoreductase  34.27 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.300054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  32.4 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1364  putative glucose/ribitol dehydrogenase  30 
 
 		 257 aa  99.4  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.333439999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2709  oxidoreductase  32.65 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 		 257 aa  99  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.981738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 244 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.977766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000468902  normal  0.0104317 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0190  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 		 259 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0199  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 		 259 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2475  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.51 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000418459  decreased coverage  0.00157029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000312486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>