More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4792 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
241 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.32 
 
 
251 aa  231  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.16 
 
 
256 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
248 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
248 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
248 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
250 aa  176  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
263 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  42.5 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
248 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  39.24 
 
 
248 aa  171  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
248 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  40.17 
 
 
248 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
247 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  41.1 
 
 
250 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
248 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  38.84 
 
 
250 aa  164  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  43.57 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 
249 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 
249 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 
250 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
249 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  39.08 
 
 
249 aa  154  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.28 
 
 
249 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.743298  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
250 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
250 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 
245 aa  152  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3696  short chain dehydrogenase  40.66 
 
 
278 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0367097  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 
253 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1738  short chain dehydrogenase  39.42 
 
 
278 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0147369  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
249 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.13 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  37.39 
 
 
251 aa  146  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4098  short chain dehydrogenase  39.83 
 
 
249 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4268  short chain dehydrogenase  39.83 
 
 
249 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
249 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
248 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
250 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
252 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4169  short chain dehydrogenase  40.25 
 
 
249 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00125324  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
247 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
250 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 
248 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
250 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
250 aa  141  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1489  short chain dehydrogenase  39.67 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129489  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  39.33 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3249  short chain dehydrogenase  39 
 
 
249 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116631  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
258 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
249 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2727  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932234  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
246 aa  135  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
254 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
247 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170214  normal  0.189904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  39.08 
 
 
251 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
257 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
246 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.91 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.91 
 
 
244 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
249 aa  129  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3976  acetoacetyl-CoA reductase  33.74 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1230  acetoacetyl-CoA reductase  33.74 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.824936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1207  acetoacetyl-CoA reductase  33.74 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1209  acetoacetyl-CoA reductase  33.74 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00888886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1330  acetoacetyl-CoA reductase  33.74 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1405  acetoacetyl-CoA reductase  33.74 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1368  acetoacetyl-CoA reductase  33.74 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.194105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1470  acetoacetyl-CoA reductase  33.74 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1429  acetoacetyl-CoA reductase  33.74 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3998  short chain dehydrogenase  34.71 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4111  short chain dehydrogenase  34.71 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1231  acetoacetyl-CoA reductase  33.74 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
256 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.945101  normal  0.897274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  37.19 
 
 
260 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
258 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.899344  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>