More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2371 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
244 aa  494  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.48 
 
 
244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.66 
 
 
244 aa  298  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.07 
 
 
244 aa  298  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.84 
 
 
244 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1096  glucose dehydrogenase  59.84 
 
 
244 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0163868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.43 
 
 
244 aa  292  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.84 
 
 
244 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.84 
 
 
244 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.23 
 
 
249 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.7 
 
 
249 aa  279  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.07 
 
 
244 aa  278  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.51 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
249 aa  271  7e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.89 
 
 
246 aa  266  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.65 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.23 
 
 
244 aa  265  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58 
 
 
253 aa  264  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.64 
 
 
244 aa  263  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 
244 aa  259  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.98 
 
 
254 aa  255  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
250 aa  255  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.78 
 
 
254 aa  254  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.78 
 
 
254 aa  254  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.07 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.18 
 
 
254 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.18 
 
 
254 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56 
 
 
260 aa  251  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.82 
 
 
250 aa  250  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.78 
 
 
254 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 
254 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 
254 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.21 
 
 
249 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
249 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 
250 aa  236  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.28 
 
 
245 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.24 
 
 
256 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.75 
 
 
244 aa  228  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.64 
 
 
244 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 
243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.270613  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.36 
 
 
242 aa  218  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.81 
 
 
252 aa  215  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.31 
 
 
243 aa  214  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.58 
 
 
247 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 
249 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.94 
 
 
248 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.5 
 
 
250 aa  205  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
248 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0140794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 
243 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2727  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
252 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932234  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
245 aa  198  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0218272  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
250 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
249 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
255 aa  188  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
249 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
247 aa  185  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
249 aa  184  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  45.9 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  44.9 
 
 
248 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
258 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.86 
 
 
251 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 
249 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
250 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
248 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 
249 aa  178  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  43.62 
 
 
260 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  42.45 
 
 
249 aa  178  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  43.27 
 
 
245 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 
250 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 
250 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
251 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
248 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
249 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  41.22 
 
 
250 aa  175  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 
248 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
259 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
246 aa  175  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 
249 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  40.49 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170214  normal  0.189904 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.945101  normal  0.897274 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3998  short chain dehydrogenase  40.23 
 
 
253 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4111  short chain dehydrogenase  40.23 
 
 
253 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
247 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>