More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6998 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
244 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.57 
 
 
244 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.93 
 
 
244 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1096  glucose dehydrogenase  88.93 
 
 
244 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0163868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.52 
 
 
244 aa  430  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.11 
 
 
244 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.66 
 
 
244 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.89 
 
 
244 aa  418  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.93 
 
 
244 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.07 
 
 
244 aa  298  7e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.51 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.43 
 
 
249 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.46 
 
 
244 aa  263  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 
249 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 
248 aa  258  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.42 
 
 
251 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.05 
 
 
244 aa  259  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.82 
 
 
250 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 
254 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.06 
 
 
249 aa  244  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.46 
 
 
246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 
250 aa  239  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 
254 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 
254 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.38 
 
 
254 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
252 aa  238  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.78 
 
 
253 aa  234  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
254 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
254 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.43 
 
 
260 aa  221  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.75 
 
 
244 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.39 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.04 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.05 
 
 
244 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 
256 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
249 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 
249 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.76 
 
 
243 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.270613  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2727  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
252 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932234  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 
242 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
250 aa  189  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
248 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 
252 aa  188  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
243 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
258 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
258 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.98 
 
 
248 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0140794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
249 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  45.08 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
257 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
258 aa  178  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.899344  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
245 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0218272  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
249 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
250 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.68 
 
 
251 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 
251 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  40 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 
248 aa  171  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
247 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
255 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 
250 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
248 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
248 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
263 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
248 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 
249 aa  168  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
249 aa  168  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
249 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
248 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
243 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
249 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
249 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 
249 aa  161  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  41.22 
 
 
245 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1489  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 
249 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129489  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
256 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.945101  normal  0.897274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
255 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 
248 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 
249 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
247 aa  158  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
250 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
254 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
250 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
247 aa  156  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
258 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
252 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>