More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1661 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
249 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.2 
 
 
250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.47 
 
 
251 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.25 
 
 
246 aa  258  8e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.69 
 
 
249 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 
249 aa  250  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 
254 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 
254 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.99 
 
 
254 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
250 aa  244  6.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.96 
 
 
254 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.2 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.37 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 
254 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 
254 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 
254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 
250 aa  242  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
249 aa  239  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.81 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.41 
 
 
244 aa  237  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.25 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
248 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.2 
 
 
249 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 
248 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
250 aa  229  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
249 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 
253 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.58 
 
 
249 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.56 
 
 
251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.21 
 
 
245 aa  218  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 
244 aa  218  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.01 
 
 
250 aa  218  7.999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 
249 aa  215  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 
260 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.02 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  45.78 
 
 
249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.5 
 
 
247 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
244 aa  208  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 
244 aa  208  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
244 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
244 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
249 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 
255 aa  206  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1096  glucose dehydrogenase  46.59 
 
 
244 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0163868 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 
244 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
250 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
248 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
248 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2727  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
252 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932234  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  43.67 
 
 
248 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.12 
 
 
258 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
244 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
248 aa  202  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0140794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
250 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 
250 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  40.65 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 
256 aa  198  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.945101  normal  0.897274 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 
243 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 
250 aa  198  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
244 aa  198  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
257 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  42.97 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
250 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 
242 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.94 
 
 
258 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  44.72 
 
 
250 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 
249 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
263 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  45.16 
 
 
251 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  42.68 
 
 
250 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
248 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
247 aa  193  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  45.9 
 
 
260 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
243 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.270613  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
243 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 
244 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
259 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  43.37 
 
 
249 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 
249 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 
244 aa  188  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
247 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4098  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 
249 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4268  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 
249 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
258 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
246 aa  185  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  40.65 
 
 
248 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3998  short chain dehydrogenase  42.29 
 
 
253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.4 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>