More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4615 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
247 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.66 
 
 
247 aa  277  9e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  50.2 
 
 
251 aa  238  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.58 
 
 
250 aa  238  9e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
258 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
247 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
249 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  44.76 
 
 
249 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
250 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 
249 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
250 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
251 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
247 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170214  normal  0.189904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4111  short chain dehydrogenase  43.25 
 
 
253 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
249 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3998  short chain dehydrogenase  43.25 
 
 
253 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
244 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
249 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4098  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 
249 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4268  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 
249 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
249 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  42.23 
 
 
251 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 
250 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
249 aa  178  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
246 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
251 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
244 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1489  short chain dehydrogenase  41.53 
 
 
249 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129489  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
249 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
249 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
244 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 
250 aa  171  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
254 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
244 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
245 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1738  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 
278 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0147369  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 
250 aa  168  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 
250 aa  168  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
245 aa  168  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
249 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
248 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3696  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 
278 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0367097  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4169  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 
249 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00125324  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3249  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 
249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116631  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
254 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
254 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
248 aa  164  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0140794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
254 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
249 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
258 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
248 aa  161  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
246 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
250 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
256 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
250 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
244 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
254 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
244 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2727  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
252 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932234  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
257 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
244 aa  158  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
253 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150046 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
248 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
256 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
253 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
243 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
243 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.270613  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
248 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  40.41 
 
 
251 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
253 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
258 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
246 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
244 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1096  glucose dehydrogenase  37.55 
 
 
244 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0163868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
244 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
244 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
242 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
260 aa  148  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
255 aa  148  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>