More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1562 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.28 
 
 
249 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.75 
 
 
249 aa  323  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.32 
 
 
251 aa  321  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.75 
 
 
250 aa  314  8e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.55 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.95 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.95 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.73 
 
 
250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.55 
 
 
254 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.55 
 
 
254 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.15 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.55 
 
 
254 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.55 
 
 
254 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64 
 
 
253 aa  291  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.51 
 
 
244 aa  291  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.32 
 
 
249 aa  287  9e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
246 aa  280  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.51 
 
 
244 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.51 
 
 
244 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.28 
 
 
244 aa  277  9e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.68 
 
 
244 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.45 
 
 
244 aa  277  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.51 
 
 
244 aa  275  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.07 
 
 
252 aa  275  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.94 
 
 
244 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1096  glucose dehydrogenase  58.7 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0163868 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 
244 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.06 
 
 
244 aa  271  6e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.73 
 
 
260 aa  271  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
244 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.8 
 
 
250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.91 
 
 
245 aa  262  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.04 
 
 
249 aa  254  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.73 
 
 
244 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.81 
 
 
249 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 
244 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.39 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.72 
 
 
244 aa  241  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
249 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
249 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.15 
 
 
247 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
249 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.33 
 
 
249 aa  218  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 
248 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2727  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.8 
 
 
252 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932234  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
257 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 
243 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.270613  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.54 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0140794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 
242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
249 aa  211  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.74 
 
 
249 aa  211  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 
252 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.02 
 
 
245 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0218272  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
248 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
243 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
255 aa  206  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.13 
 
 
249 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.36 
 
 
250 aa  205  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
248 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  44.26 
 
 
260 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
248 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.31 
 
 
250 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
249 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
248 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
263 aa  201  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
255 aa  201  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
250 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.02 
 
 
249 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.26 
 
 
251 aa  194  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  43.72 
 
 
249 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 
250 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 
249 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  43.21 
 
 
250 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
259 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
246 aa  192  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  42.39 
 
 
250 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  42.39 
 
 
248 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
249 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1489  short chain dehydrogenase  43.72 
 
 
249 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129489  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  42.39 
 
 
250 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
258 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.899344  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  40.74 
 
 
248 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
250 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  41.56 
 
 
248 aa  189  5e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
243 aa  188  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  43.21 
 
 
248 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
249 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  41.15 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  44.26 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4111  short chain dehydrogenase  42.58 
 
 
253 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.173439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>