More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3531 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
244 aa  493  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.54 
 
 
244 aa  366  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.49 
 
 
244 aa  358  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.26 
 
 
244 aa  355  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.41 
 
 
249 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.03 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.37 
 
 
246 aa  252  5.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 
248 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.22 
 
 
249 aa  250  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.22 
 
 
250 aa  246  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
254 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
254 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 
249 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 
250 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.75 
 
 
244 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
254 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
254 aa  238  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
254 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
254 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.18 
 
 
244 aa  238  8e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
254 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.17 
 
 
244 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.75 
 
 
244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.92 
 
 
244 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1096  glucose dehydrogenase  48.33 
 
 
244 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0163868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.18 
 
 
244 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.75 
 
 
244 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
244 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.46 
 
 
243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.270613  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.9 
 
 
249 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
252 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 
253 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.05 
 
 
245 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.17 
 
 
244 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
249 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.36 
 
 
260 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
249 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 
249 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.35 
 
 
251 aa  202  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 
248 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0140794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
249 aa  201  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2727  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
252 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932234  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
249 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.36 
 
 
244 aa  197  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
242 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
249 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.27 
 
 
250 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
247 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
255 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
249 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
258 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
243 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
250 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
248 aa  185  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
258 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0218272  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
250 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
257 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
250 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
256 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.945101  normal  0.897274 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
250 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
252 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
258 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 
249 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.9 
 
 
249 aa  175  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
247 aa  175  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
259 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
246 aa  175  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  42.04 
 
 
260 aa  175  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
243 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
247 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  42.21 
 
 
251 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 
247 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.33 
 
 
183 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
252 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.899344  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
248 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  36.03 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.83 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170214  normal  0.189904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
249 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  40 
 
 
245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  36.44 
 
 
249 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  36.69 
 
 
249 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 
248 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
253 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
250 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.31 
 
 
247 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>