More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1098 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
249 aa  495  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.28 
 
 
248 aa  357  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.56 
 
 
249 aa  315  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.35 
 
 
254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.3 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.69 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.35 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.95 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.35 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.95 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 
250 aa  302  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.75 
 
 
254 aa  296  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.35 
 
 
254 aa  294  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.76 
 
 
249 aa  293  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.87 
 
 
250 aa  292  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.6 
 
 
253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.23 
 
 
244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.13 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.43 
 
 
244 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.63 
 
 
244 aa  279  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.63 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.44 
 
 
244 aa  271  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.04 
 
 
244 aa  271  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 
246 aa  268  5e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.83 
 
 
244 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1096  glucose dehydrogenase  57.83 
 
 
244 aa  266  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0163868 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.23 
 
 
244 aa  266  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54 
 
 
250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.43 
 
 
244 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 
244 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.85 
 
 
260 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.83 
 
 
244 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.82 
 
 
244 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.42 
 
 
245 aa  254  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.21 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.41 
 
 
244 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.43 
 
 
244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
249 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
242 aa  235  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.64 
 
 
256 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.2 
 
 
249 aa  232  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
249 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.41 
 
 
243 aa  224  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.270613  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
243 aa  221  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.09 
 
 
250 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.83 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.76 
 
 
249 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2727  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.4 
 
 
252 aa  218  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932234  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 
249 aa  211  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
255 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
245 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0218272  normal  0.740514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 
247 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
255 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
243 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
249 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
258 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  46.5 
 
 
260 aa  204  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
248 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  44.98 
 
 
249 aa  201  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.68 
 
 
258 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.67 
 
 
251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
252 aa  198  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
248 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 
256 aa  198  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.945101  normal  0.897274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.9 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
248 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
263 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 
250 aa  195  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
248 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
249 aa  195  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
249 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
248 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
248 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  42.17 
 
 
249 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
248 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0140794 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
247 aa  191  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
248 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  42.17 
 
 
249 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
250 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
250 aa  188  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 
250 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  42.57 
 
 
249 aa  187  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  43.27 
 
 
250 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 
249 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 
250 aa  184  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4111  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3998  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  42.45 
 
 
248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 
250 aa  181  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
248 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
259 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
250 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
247 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
248 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>