More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4205 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  100 
 
 
249 aa  494  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  68.67 
 
 
249 aa  331  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4111  short chain dehydrogenase  68.38 
 
 
253 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3998  short chain dehydrogenase  68.38 
 
 
253 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4098  short chain dehydrogenase  64.26 
 
 
249 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4268  short chain dehydrogenase  64.26 
 
 
249 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1738  short chain dehydrogenase  63.86 
 
 
278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0147369  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1489  short chain dehydrogenase  68.27 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129489  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3696  short chain dehydrogenase  63.45 
 
 
278 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0367097  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3249  short chain dehydrogenase  64.66 
 
 
249 aa  295  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116631  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4169  short chain dehydrogenase  63.45 
 
 
249 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00125324  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  56.22 
 
 
249 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  58.23 
 
 
249 aa  288  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  53.41 
 
 
245 aa  256  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.41 
 
 
249 aa  248  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  47.77 
 
 
248 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  48.16 
 
 
250 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 
250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  48.18 
 
 
248 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  46.94 
 
 
248 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  48.16 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  48.98 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  50.2 
 
 
249 aa  238  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  46.12 
 
 
250 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  51.41 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 
247 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 
249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
249 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
249 aa  208  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
263 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.53 
 
 
251 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
248 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
248 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
250 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
248 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
258 aa  201  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.67 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
248 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  48.56 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.63 
 
 
254 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
248 aa  195  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
248 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
254 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
254 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.95 
 
 
260 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
247 aa  193  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
246 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
254 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
250 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
257 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
251 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
249 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
259 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 
254 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
249 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
250 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
250 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
250 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.08 
 
 
247 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170214  normal  0.189904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
253 aa  185  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
249 aa  184  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
246 aa  184  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
242 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
244 aa  182  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
249 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
244 aa  181  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
258 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
249 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
257 aa  178  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  0.0943454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
248 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
244 aa  176  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
244 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
244 aa  175  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.899344  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0140794 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  42 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
249 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1096  glucose dehydrogenase  41.2 
 
 
244 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0163868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
250 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
255 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
244 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>