More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1616 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0140794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.05 
 
 
249 aa  260  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.2 
 
 
250 aa  256  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
246 aa  250  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 
244 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.77 
 
 
244 aa  238  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.36 
 
 
244 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 
250 aa  232  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.23 
 
 
251 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
250 aa  231  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.21 
 
 
253 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 
248 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 
254 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
254 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 
254 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 
254 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.2 
 
 
254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.99 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.8 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.2 
 
 
254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.2 
 
 
254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
244 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 
249 aa  218  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2727  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
252 aa  218  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932234  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
252 aa  217  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.19 
 
 
244 aa  216  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 
260 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
244 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
249 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.03 
 
 
256 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
244 aa  214  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 
248 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 
249 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1096  glucose dehydrogenase  47.98 
 
 
244 aa  208  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0163868 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.98 
 
 
244 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 
247 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.12 
 
 
250 aa  201  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 
243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.270613  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.9 
 
 
249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
250 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  44.58 
 
 
249 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
249 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  44.98 
 
 
249 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
249 aa  192  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 
244 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.37 
 
 
250 aa  192  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
248 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  42.04 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
263 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
248 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
248 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  46.37 
 
 
251 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 
250 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
247 aa  184  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
242 aa  184  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1489  short chain dehydrogenase  45.38 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129489  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4111  short chain dehydrogenase  43.08 
 
 
253 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3998  short chain dehydrogenase  43.08 
 
 
253 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 
248 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
243 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4098  short chain dehydrogenase  45.93 
 
 
249 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4268  short chain dehydrogenase  45.93 
 
 
249 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  0.279758 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  43.57 
 
 
251 aa  180  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.37 
 
 
244 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 
250 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.63 
 
 
251 aa  178  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1738  short chain dehydrogenase  44.9 
 
 
278 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0147369  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
247 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170214  normal  0.189904 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3696  short chain dehydrogenase  45.31 
 
 
278 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0367097  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 
248 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
247 aa  175  6e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
248 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
251 aa  174  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 
249 aa  174  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
249 aa  174  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  44.63 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.87 
 
 
202 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
252 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
248 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 
249 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
243 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>