More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0480 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 251 aa  481  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.09 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  46.34 
 
 		 248 aa  221  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  45.93 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  45.12 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  46.34 
 
 		 250 aa  214  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  43.09 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.32 
 
 		 241 aa  211  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  42.97 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  41.87 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.78 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  41.3 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  43.55 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  41.3 
 
 		 249 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  41.53 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 		 263 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 		 246 aa  185  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 		 248 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  42.19 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.73 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  41.3 
 
 		 249 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 248 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  41.7 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.54 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 		 258 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 254 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.35 
 
 		 251 aa  171  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1738  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 278 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0147369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3696  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0367097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4098  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4268  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1489  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129489  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4169  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00125324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.743298  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 247 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170214  normal  0.189904 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 		 253 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3249  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  38.91 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4111  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3998  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0140794 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2727  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0380  ATPase  36.02 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.647768 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 251 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 250 aa  148  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 242 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>