More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1276 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  100 
 
 
245 aa  484  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  59.84 
 
 
249 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  60.24 
 
 
249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  59.84 
 
 
248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  53.04 
 
 
248 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  53.47 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  52.24 
 
 
250 aa  269  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  52.24 
 
 
250 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  51.63 
 
 
248 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  52.63 
 
 
248 aa  266  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  52.24 
 
 
250 aa  262  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  51.59 
 
 
249 aa  256  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  53.41 
 
 
249 aa  251  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  52.21 
 
 
249 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4111  short chain dehydrogenase  52.34 
 
 
253 aa  234  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3998  short chain dehydrogenase  52.34 
 
 
253 aa  234  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
249 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1489  short chain dehydrogenase  51.81 
 
 
249 aa  221  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129489  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4098  short chain dehydrogenase  48.59 
 
 
249 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4268  short chain dehydrogenase  48.59 
 
 
249 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1738  short chain dehydrogenase  49.4 
 
 
278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0147369  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.78 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
250 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
252 aa  208  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3696  short chain dehydrogenase  48.19 
 
 
278 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0367097  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3249  short chain dehydrogenase  49 
 
 
249 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116631  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
263 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4169  short chain dehydrogenase  48.59 
 
 
249 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00125324  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
248 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
248 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.94 
 
 
251 aa  193  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
248 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
247 aa  189  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
248 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
248 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
249 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  47.77 
 
 
260 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
250 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.71 
 
 
257 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
249 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
248 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
250 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
244 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
251 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
258 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
251 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
244 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
249 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
258 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
260 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
249 aa  175  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
249 aa  174  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
244 aa  174  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  42.04 
 
 
251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
249 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
249 aa  171  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
248 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
249 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
254 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
254 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
248 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
247 aa  169  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
249 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
254 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
254 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
254 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
254 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
247 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
254 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
258 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
255 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
254 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.743298  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.945101  normal  0.897274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.899344  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
256 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2727  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
252 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932234  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
244 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
243 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.270613  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
250 aa  159  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
249 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
253 aa  158  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
247 aa  158  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170214  normal  0.189904 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
258 aa  158  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
246 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  35.95 
 
 
251 aa  156  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
249 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.801422  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
249 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>