More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3370 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
245 aa  169  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.466284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
250 aa  158  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
250 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
248 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  38.62 
 
 
249 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
247 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.991587  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  38.21 
 
 
248 aa  154  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 
250 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.69 
 
 
251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1853  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
250 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
244 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.317025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 
244 aa  142  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000275266  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
247 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 
249 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.872863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
250 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
250 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0923902  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 
249 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
259 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
257 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 
248 aa  135  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
248 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
250 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
250 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
258 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.899344  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
249 aa  131  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4098  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4268  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3691  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
254 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
254 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
254 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
257 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  0.0943454 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
253 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
247 aa  128  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170214  normal  0.189904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1489  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129489  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  37.45 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
249 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1738  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 
278 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0147369  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
260 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
249 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
251 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
254 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
267 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3696  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
278 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0367097  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.25 
 
 
249 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
248 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
250 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
249 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
248 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316279  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
249 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
248 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.445893 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
244 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
250 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
250 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
254 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
249 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 
243 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
248 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
248 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
248 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
244 aa  121  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.240645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
248 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
249 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143901  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4169  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00125324  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
247 aa  119  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  33.06 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3249  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 
249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116631  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
258 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
246 aa  119  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
246 aa  119  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>