More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2513 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
262 aa  535  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.13 
 
 
256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.84 
 
 
254 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1563  oxidoreductase  59.76 
 
 
257 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.256146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  57.96 
 
 
257 aa  278  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2002  oxidoreductase  57.96 
 
 
257 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1670  oxidoreductase  59.68 
 
 
272 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0171077  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.5 
 
 
255 aa  276  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  57.55 
 
 
257 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2709  oxidoreductase  58.06 
 
 
258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1904  oxidoreductase  58.06 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1364  putative glucose/ribitol dehydrogenase  57.09 
 
 
257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.333439999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3809  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  57.79 
 
 
241 aa  268  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.56 
 
 
249 aa  268  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.69 
 
 
249 aa  264  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0696  glucose 1-dehydrogenase  55.24 
 
 
252 aa  262  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.97 
 
 
306 aa  260  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34130  oxidoreductase  53.88 
 
 
260 aa  256  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2027  oxidoreductase  57.48 
 
 
255 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.274157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.17 
 
 
255 aa  251  8.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.18 
 
 
267 aa  248  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23950  oxidoreductase  56.08 
 
 
255 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.44 
 
 
255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.8 
 
 
254 aa  239  4e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03085  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  50 
 
 
250 aa  229  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.28 
 
 
249 aa  225  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675189  normal  0.198967 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.41 
 
 
302 aa  225  7e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 
256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
249 aa  221  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.2 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0926  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.82 
 
 
256 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0904  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.82 
 
 
256 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
235 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 
225 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 
249 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
252 aa  203  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.184681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1912  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.387305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
247 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.2 
 
 
250 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
241 aa  168  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.40468  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05160  oxidoreductase  38.58 
 
 
241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
249 aa  163  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.879762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
252 aa  160  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  40.08 
 
 
257 aa  156  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.96 
 
 
246 aa  155  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.96 
 
 
246 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
252 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
261 aa  151  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  38.58 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
272 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
257 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
250 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
256 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
269 aa  149  6e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  37.25 
 
 
247 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
254 aa  148  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
248 aa  148  8e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
253 aa  148  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4004  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132038  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.06 
 
 
251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.598293 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
253 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  40 
 
 
253 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
257 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  37.74 
 
 
261 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  37.5 
 
 
261 aa  145  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
268 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
254 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
258 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  38.31 
 
 
261 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  37.74 
 
 
261 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
251 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0594  putative short-chain type dehydrogenase  36.84 
 
 
252 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.722821  normal  0.132881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
259 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 
253 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  38.37 
 
 
253 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
291 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60014  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 
247 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
255 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
261 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
268 aa  142  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  37.35 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.86 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.27 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.890979 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.71 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3076  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.848972 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  36.99 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  37.5 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  37.85 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  33.72 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  37.1 
 
 
261 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>