More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2444 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
306 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.34 
 
 
262 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.76 
 
 
256 aa  263  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.71 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.1 
 
 
255 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1364  putative glucose/ribitol dehydrogenase  51.08 
 
 
257 aa  235  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.333439999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2709  oxidoreductase  49.82 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1904  oxidoreductase  48.21 
 
 
255 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1563  oxidoreductase  49.28 
 
 
257 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.256146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  49.28 
 
 
257 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2002  oxidoreductase  48.56 
 
 
257 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  48.56 
 
 
257 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0696  glucose 1-dehydrogenase  46.62 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1670  oxidoreductase  44.48 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0171077  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 
249 aa  215  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.52 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34130  oxidoreductase  46.04 
 
 
260 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23950  oxidoreductase  50.36 
 
 
255 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
255 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2027  oxidoreductase  50.36 
 
 
255 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.274157  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.23 
 
 
267 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3809  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  44.4 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
249 aa  195  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675189  normal  0.198967 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.78 
 
 
255 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
252 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.184681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03085  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  44.8 
 
 
250 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
235 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
264 aa  182  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
254 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.01 
 
 
302 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0904  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.81 
 
 
256 aa  176  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0926  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.74 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.22 
 
 
225 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 
247 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.73 
 
 
249 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.01 
 
 
299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1912  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
248 aa  152  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.387305  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4004  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 
259 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132038  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
254 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.23 
 
 
249 aa  138  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.879762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.56 
 
 
250 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
241 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.40468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.84 
 
 
250 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.93 
 
 
269 aa  132  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 
253 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  29.18 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0592411  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 
253 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
250 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
258 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.84 
 
 
251 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.09 
 
 
251 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  35.27 
 
 
248 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  0.250737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
262 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.753255  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.85 
 
 
251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 
257 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.51 
 
 
266 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
249 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0144582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000195486  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
252 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
252 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
249 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.999176  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
286 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
262 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4102  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 
256 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.188504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.83 
 
 
246 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
246 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  35.35 
 
 
269 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0917  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.69 
 
 
249 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.213986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
263 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0128625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.45 
 
 
249 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4567  short chain dehydrogenase  38.65 
 
 
256 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.16205  hitchhiker  0.000267636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
262 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
250 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0628218  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.36 
 
 
247 aa  123  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
251 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.13 
 
 
248 aa  122  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
268 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
252 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1308  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
256 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
262 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 
256 aa  122  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5592  short chain dehydrogenase  38.79 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0383111 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.66 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2910  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.28 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26924  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.36 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  34.64 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3659  short chain dehydrogenase  38.79 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.821403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60014  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.22 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0982  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.34 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.0572265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>