More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0269 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
249 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.1 
 
 
249 aa  314  8e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
256 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.41 
 
 
255 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 
249 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
264 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.94 
 
 
249 aa  229  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675189  normal  0.198967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
256 aa  226  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.95 
 
 
255 aa  218  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.85 
 
 
255 aa  216  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1364  putative glucose/ribitol dehydrogenase  48.05 
 
 
257 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.333439999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.89 
 
 
249 aa  216  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0696  glucose 1-dehydrogenase  45 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
254 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05160  oxidoreductase  41.13 
 
 
241 aa  205  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.5 
 
 
299 aa  204  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 
262 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0926  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.31 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.55 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0904  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.91 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1563  oxidoreductase  44.66 
 
 
257 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.256146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2002  oxidoreductase  44.27 
 
 
257 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  44.27 
 
 
257 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  44.27 
 
 
257 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1904  oxidoreductase  45.24 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2709  oxidoreductase  44.4 
 
 
258 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34130  oxidoreductase  45.06 
 
 
260 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1670  oxidoreductase  42.52 
 
 
272 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0171077  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.11 
 
 
235 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03085  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  42.52 
 
 
250 aa  178  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3809  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  44.53 
 
 
241 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.184681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1912  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.78 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.387305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.65 
 
 
248 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  41.08 
 
 
254 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  38.17 
 
 
261 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
254 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.73 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2027  oxidoreductase  43.95 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.274157  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.17 
 
 
306 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
248 aa  162  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.78 
 
 
245 aa  162  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
254 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
254 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.799434 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
254 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.92 
 
 
245 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
248 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
256 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.69 
 
 
245 aa  159  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
282 aa  158  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16790  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  37.45 
 
 
253 aa  158  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.821391 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
272 aa  158  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.67 
 
 
249 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
253 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
256 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
253 aa  156  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
247 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
252 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
246 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35 
 
 
245 aa  156  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.63 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.46 
 
 
247 aa  155  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.66 
 
 
245 aa  155  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3977  putative 2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.62 
 
 
255 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686311  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
246 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.63 
 
 
247 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
270 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.41 
 
 
245 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
258 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.04 
 
 
246 aa  153  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3106  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.63 
 
 
246 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000229278  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
251 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
249 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23950  oxidoreductase  42.74 
 
 
255 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.55 
 
 
246 aa  152  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
256 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
261 aa  152  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.69 
 
 
247 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
252 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 
259 aa  151  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.71 
 
 
246 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
268 aa  150  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
259 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0830  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.21 
 
 
249 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
257 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35 
 
 
246 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.27 
 
 
245 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2335  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.86 
 
 
253 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  40.57 
 
 
254 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  37.19 
 
 
259 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
249 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
254 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
249 aa  150  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.879762  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
251 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.02 
 
 
250 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 
258 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>