More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1173 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
256 aa  528  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  61.26 
 
 
255 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0904  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.87 
 
 
256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0926  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.87 
 
 
256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.73 
 
 
299 aa  278  9e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.9 
 
 
302 aa  275  5e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.12 
 
 
255 aa  261  8.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 
249 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.523448  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 
256 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.83 
 
 
249 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.85 
 
 
249 aa  238  5.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.62 
 
 
249 aa  238  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.63 
 
 
249 aa  234  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.675189  normal  0.198967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1364  putative glucose/ribitol dehydrogenase  49.61 
 
 
257 aa  232  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.333439999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
264 aa  231  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0696  glucose 1-dehydrogenase  45.85 
 
 
252 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.66 
 
 
254 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 
255 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 
262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1563  oxidoreductase  46.61 
 
 
257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.256146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  45.82 
 
 
257 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2002  oxidoreductase  45.42 
 
 
257 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  45.02 
 
 
257 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1904  oxidoreductase  46.22 
 
 
255 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
267 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1670  oxidoreductase  44.53 
 
 
272 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0171077  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34130  oxidoreductase  45.24 
 
 
260 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3809  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  44.94 
 
 
241 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2709  oxidoreductase  44.62 
 
 
258 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03085  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  39.68 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
254 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
252 aa  191  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.184681  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
247 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
257 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622704  normal  0.299827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
246 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
272 aa  184  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2027  oxidoreductase  45.24 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.274157  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.8 
 
 
246 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05160  oxidoreductase  37.01 
 
 
241 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.76 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 
249 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
252 aa  181  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
250 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  40.41 
 
 
261 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.8 
 
 
248 aa  179  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
261 aa  178  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
249 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
250 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
256 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.68 
 
 
246 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
253 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
246 aa  175  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
268 aa  175  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.879762  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23950  oxidoreductase  43.25 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.44 
 
 
245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  36.8 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  37.1 
 
 
247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
263 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.56 
 
 
250 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
250 aa  171  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
251 aa  171  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.29 
 
 
246 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
247 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
263 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
276 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
247 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
257 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 
247 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  36.74 
 
 
259 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  36.74 
 
 
259 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 
306 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1022  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
261 aa  169  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  36.74 
 
 
259 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  36.74 
 
 
259 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
254 aa  168  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
246 aa  168  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
246 aa  168  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.51 
 
 
246 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
254 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.51 
 
 
246 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
258 aa  168  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
260 aa  168  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
256 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  36.78 
 
 
269 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
248 aa  167  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
259 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 
255 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
267 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 
253 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
251 aa  166  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
253 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
258 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>