More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1659 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.33 
 
 
252 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  53.31 
 
 
257 aa  261  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0242  Short-chain alcohol dehydrogenase  48.81 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.51 
 
 
268 aa  228  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.81 
 
 
251 aa  216  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.43 
 
 
246 aa  210  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0373  Short-chain alcohol dehydrogenase  45.63 
 
 
243 aa  208  5e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.03 
 
 
246 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  43.24 
 
 
258 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  43.82 
 
 
247 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
248 aa  205  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 
244 aa  205  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
246 aa  205  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  43.65 
 
 
247 aa  205  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
248 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
248 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
245 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
245 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
253 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
245 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
249 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
255 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
245 aa  199  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
252 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.89 
 
 
271 aa  198  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
244 aa  195  5.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
251 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2217  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 
258 aa  195  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
256 aa  195  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
253 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
250 aa  194  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
264 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
255 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201856  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
249 aa  192  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
252 aa  191  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
249 aa  191  9e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
248 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
253 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 
251 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  41.41 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 
254 aa  189  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
251 aa  188  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
260 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
255 aa  188  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0696546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.77 
 
 
256 aa  188  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
260 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
250 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  42.58 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
251 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
257 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
249 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
252 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  43.37 
 
 
260 aa  180  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  43.03 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
261 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
250 aa  178  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
251 aa  178  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0875  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
259 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0875261  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
250 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
259 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  39.92 
 
 
282 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
250 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
252 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
264 aa  175  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  43.92 
 
 
257 aa  174  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0671  putative short-chain dehydrogenase/reductase  42.8 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121073  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.34 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  41.11 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.52 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  41.83 
 
 
261 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
272 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3121  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 
267 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  42.23 
 
 
261 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 
251 aa  171  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  42.23 
 
 
261 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 
257 aa  171  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
263 aa  171  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2292  short chain dehydrogenase  36.78 
 
 
262 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295109 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
262 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.545921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
252 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  41.83 
 
 
261 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 
249 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  41.83 
 
 
261 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  41.83 
 
 
261 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4559  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 
262 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>