More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2292 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2292  short chain dehydrogenase  100 
 
 
262 aa  526  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295109 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3720  short chain dehydrogenase  96.95 
 
 
262 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0906259  normal  0.2081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4559  short chain dehydrogenase  96.95 
 
 
262 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3804  short chain dehydrogenase  96.95 
 
 
262 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5530  short chain dehydrogenase  93.89 
 
 
262 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3706  short chain dehydrogenase  93.51 
 
 
262 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  88.17 
 
 
262 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.545921 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2511  short chain dehydrogenase  75.29 
 
 
267 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0246  short chain dehydrogenase  75.29 
 
 
265 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1627  short chain dehydrogenase  75.29 
 
 
259 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0943  short chain dehydrogenase  75.29 
 
 
265 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0524  short chain dehydrogenase  74.9 
 
 
263 aa  394  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2649  short chain dehydrogenase  75.29 
 
 
259 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0283  short chain dehydrogenase  75.29 
 
 
259 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.879782  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1430  short chain dehydrogenase  75.29 
 
 
265 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1966  short chain dehydrogenase  67.31 
 
 
262 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.783196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  48.09 
 
 
261 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0875  short chain dehydrogenase  50 
 
 
259 aa  228  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0875261  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  44.92 
 
 
261 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  42.02 
 
 
257 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 
269 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 
252 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
251 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
252 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  42.91 
 
 
258 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  41.95 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
252 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
251 aa  171  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 
255 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201856  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0242  Short-chain alcohol dehydrogenase  35.11 
 
 
253 aa  169  5e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.06 
 
 
255 aa  168  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0696546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
256 aa  168  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
254 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0671  putative short-chain dehydrogenase/reductase  41.79 
 
 
273 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121073  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.18 
 
 
250 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2217  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 
271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
268 aa  164  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 
269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1576  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.68 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29701  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0373  Short-chain alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 
243 aa  161  8.000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
269 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
251 aa  159  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
264 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
248 aa  158  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 
269 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 
259 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  37.35 
 
 
251 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 
259 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 
269 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 
259 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 
259 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
258 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
256 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
248 aa  156  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 
259 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0769  short chain dehydrogenase  39.33 
 
 
553 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
254 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
254 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
250 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.1 
 
 
254 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
261 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
249 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.75 
 
 
273 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
259 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
245 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
245 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 
282 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
245 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 
282 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 
282 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
269 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0594  putative short-chain type dehydrogenase  38.13 
 
 
252 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.722821  normal  0.132881 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
257 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
254 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
276 aa  148  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0628218  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  36.12 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
247 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.57 
 
 
248 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 
260 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
250 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  37.4 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
254 aa  145  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
251 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.61 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>