More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1834 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
252 aa  511  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.2 
 
 
256 aa  304  9.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.77 
 
 
255 aa  301  7.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.77 
 
 
255 aa  301  7.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.23 
 
 
252 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  46.33 
 
 
257 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
256 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28835 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 
251 aa  198  6e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
250 aa  195  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
251 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 
250 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  45.56 
 
 
261 aa  191  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2286  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121961  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.16 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
254 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
271 aa  181  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
250 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
250 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
246 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  39.13 
 
 
256 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
269 aa  177  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.8 
 
 
252 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
253 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
253 aa  174  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.55 
 
 
246 aa  175  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.4 
 
 
252 aa  174  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  40.55 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3720  short chain dehydrogenase  44.57 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0906259  normal  0.2081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4559  short chain dehydrogenase  44.57 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3804  short chain dehydrogenase  44.57 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.55 
 
 
246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2292  short chain dehydrogenase  44.19 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295109 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0524  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 
253 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
251 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
255 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.04 
 
 
252 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1174  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
252 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
256 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  42.25 
 
 
262 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.545921 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  42.11 
 
 
282 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  40.62 
 
 
255 aa  169  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  42.41 
 
 
261 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5530  short chain dehydrogenase  43.02 
 
 
262 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
249 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3706  short chain dehydrogenase  43.02 
 
 
262 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
251 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0246  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
265 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0283  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
259 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.879782  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0943  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
265 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2511  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
267 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1627  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
259 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
256 aa  168  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1430  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
265 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2649  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
259 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
248 aa  168  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
252 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
245 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0875  short chain dehydrogenase  42.08 
 
 
259 aa  166  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0875261  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
252 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
249 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
245 aa  166  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
248 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
302 aa  166  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  40.55 
 
 
257 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  40.55 
 
 
257 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  40.55 
 
 
257 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  40.62 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1429  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.2 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.865814 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0242  Short-chain alcohol dehydrogenase  39.53 
 
 
253 aa  162  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
244 aa  162  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  39.37 
 
 
255 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 
255 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0696546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
256 aa  161  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
263 aa  161  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
249 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
258 aa  161  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  40.64 
 
 
251 aa  160  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
257 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 
253 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
253 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
255 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
248 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 
255 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>