More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0671 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0671  putative short-chain dehydrogenase/reductase  100 
 
 
273 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121073  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.99 
 
 
273 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1576  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  72.83 
 
 
268 aa  371  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29701  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.92 
 
 
259 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.46 
 
 
277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.02 
 
 
252 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  44.11 
 
 
258 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
256 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
251 aa  195  7e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
251 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2217  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
258 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
252 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.92 
 
 
244 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
254 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
251 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  43.89 
 
 
261 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.29 
 
 
255 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
254 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.25 
 
 
251 aa  185  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2292  short chain dehydrogenase  41.79 
 
 
262 aa  185  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295109 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  41.51 
 
 
262 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.545921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3720  short chain dehydrogenase  41.42 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0906259  normal  0.2081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4559  short chain dehydrogenase  41.42 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3804  short chain dehydrogenase  41.42 
 
 
262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  41.54 
 
 
257 aa  182  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3706  short chain dehydrogenase  41.79 
 
 
262 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
251 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5530  short chain dehydrogenase  41.79 
 
 
262 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.06 
 
 
264 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0242  Short-chain alcohol dehydrogenase  38.02 
 
 
253 aa  180  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
245 aa  180  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0373  Short-chain alcohol dehydrogenase  40.93 
 
 
243 aa  180  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
253 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
260 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
249 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0875  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0875261  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  42.75 
 
 
282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 
255 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 
255 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
259 aa  171  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0283  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 
259 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.879782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1627  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 
259 aa  171  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2649  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 
259 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  40.84 
 
 
261 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
248 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 
258 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0246  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 
265 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2511  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 
267 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0943  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 
265 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1430  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 
265 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
271 aa  169  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0524  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 
263 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
250 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
244 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.86 
 
 
246 aa  166  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
255 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.47 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0696546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
250 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.1 
 
 
282 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 
256 aa  162  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
254 aa  162  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
262 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
251 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
250 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.1 
 
 
282 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
251 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.1 
 
 
282 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 
246 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
248 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
250 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
256 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.88 
 
 
250 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7132  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.1 
 
 
257 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.928828  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
257 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.15 
 
 
245 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 
283 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
248 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
245 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
245 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
245 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  40.46 
 
 
260 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  38.78 
 
 
257 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
261 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  42.25 
 
 
257 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
253 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
248 aa  156  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 
262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
277 aa  155  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
247 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
276 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
262 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
263 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
250 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>