More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0512 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.22 
 
 
244 aa  263  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
251 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.61 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.25 
 
 
260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.01 
 
 
249 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
244 aa  227  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 
253 aa  225  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
245 aa  224  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
245 aa  224  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
245 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  53.25 
 
 
260 aa  222  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.2 
 
 
250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 
259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 
251 aa  211  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
261 aa  209  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.41 
 
 
253 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2249  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.37 
 
 
260 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113674  decreased coverage  1.89116e-19 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 
253 aa  201  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
274 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138252  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
251 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
264 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
254 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
251 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  42.8 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.31 
 
 
248 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  43.3 
 
 
257 aa  188  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
250 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
260 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
246 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.94 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1174  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.94 
 
 
246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
250 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.56 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0875  short chain dehydrogenase  42.53 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0875261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
256 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 
268 aa  181  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
252 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
250 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.73 
 
 
248 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 
250 aa  178  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
261 aa  178  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
252 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  43.8 
 
 
261 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
255 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
246 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4948  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.37 
 
 
250 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
249 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
249 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
251 aa  175  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
258 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
251 aa  175  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 
247 aa  175  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.585241  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
255 aa  175  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2217  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
258 aa  175  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
255 aa  175  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 
259 aa  175  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
246 aa  174  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000391653  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.46 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7132  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.928828  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  40.87 
 
 
256 aa  172  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.36 
 
 
246 aa  172  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.73 
 
 
248 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  42.97 
 
 
263 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  40.86 
 
 
261 aa  171  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 
263 aa  170  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.34 
 
 
248 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  42.58 
 
 
263 aa  170  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  42.58 
 
 
263 aa  170  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  42.58 
 
 
263 aa  170  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
251 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
262 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.27 
 
 
247 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  40.41 
 
 
256 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  42.58 
 
 
263 aa  170  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
253 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  42.58 
 
 
263 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  42.58 
 
 
263 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
271 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.43 
 
 
247 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  42.58 
 
 
263 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
250 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
255 aa  169  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.65 
 
 
269 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 
254 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.96 
 
 
246 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1472  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  41.6 
 
 
282 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0273044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 
246 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>