More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3357 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
247 aa  487  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.585241  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
248 aa  188  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21038  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
251 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.5 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
250 aa  178  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 
248 aa  175  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
249 aa  171  9e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
251 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
257 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
253 aa  162  7e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
246 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  37.2 
 
 
272 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
252 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
272 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
272 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39 
 
 
244 aa  159  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
250 aa  158  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
249 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
269 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
258 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  38.93 
 
 
286 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
253 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 
257 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
250 aa  156  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 
257 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
252 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000391653  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 
257 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
257 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
260 aa  155  7e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
262 aa  155  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
250 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
248 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.11 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4948  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.94 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
253 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
261 aa  152  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.11 
 
 
246 aa  152  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 
259 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
254 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 
249 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1600  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
248 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
251 aa  151  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1580  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  38.27 
 
 
255 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01588  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  38.27 
 
 
255 aa  151  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
255 aa  151  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.444586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01578  hypothetical protein  38.27 
 
 
255 aa  151  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
254 aa  151  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2011  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  38.27 
 
 
255 aa  151  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617976  normal  0.65251 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1827  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  38.27 
 
 
255 aa  151  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
277 aa  151  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1806  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  38.27 
 
 
255 aa  151  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2331  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  38.27 
 
 
255 aa  151  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
251 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
250 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.67 
 
 
264 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
244 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
263 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.67 
 
 
264 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.67 
 
 
264 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
247 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
253 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  37.31 
 
 
269 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0895  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.59 
 
 
245 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0373369 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1694  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  37.86 
 
 
255 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
258 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.55 
 
 
249 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.1 
 
 
250 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
251 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
260 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
249 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.26 
 
 
252 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
251 aa  149  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  39.29 
 
 
256 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
282 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
257 aa  148  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
263 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.02 
 
 
247 aa  148  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
263 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
263 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
263 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
263 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
249 aa  148  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3571  sorbitol dehydrogenase  35.43 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>