More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2631 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
253 aa  503  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.17 
 
 
252 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.92 
 
 
249 aa  292  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
253 aa  287  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.34 
 
 
251 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.34 
 
 
251 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 
244 aa  258  7e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.82 
 
 
245 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.82 
 
 
245 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.82 
 
 
245 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.8 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.2 
 
 
248 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.63 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  55.82 
 
 
260 aa  241  7e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.99 
 
 
259 aa  230  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 
264 aa  228  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.04 
 
 
258 aa  225  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
250 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 
248 aa  208  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 
250 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2249  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
260 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113674  decreased coverage  1.89116e-19 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
251 aa  196  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
254 aa  191  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 
251 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
251 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.08 
 
 
252 aa  188  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 
248 aa  186  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.08 
 
 
264 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.08 
 
 
264 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.08 
 
 
264 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
260 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
246 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.53 
 
 
246 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.35 
 
 
249 aa  178  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
269 aa  178  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.26 
 
 
247 aa  177  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  42.91 
 
 
246 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
263 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
245 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
246 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
263 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
245 aa  175  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.8 
 
 
247 aa  174  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
252 aa  174  9e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.17 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.17 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.77 
 
 
246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
245 aa  172  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.24 
 
 
246 aa  171  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  41.9 
 
 
257 aa  171  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
246 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  42.51 
 
 
246 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0373  Short-chain alcohol dehydrogenase  40.8 
 
 
243 aa  171  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2858  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.72 
 
 
246 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.44 
 
 
246 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.13 
 
 
244 aa  170  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
257 aa  169  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
245 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.679351  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
261 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.84 
 
 
246 aa  169  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
246 aa  168  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
244 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
245 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.37 
 
 
248 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3532  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  42.69 
 
 
282 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  42.11 
 
 
246 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 
262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1174  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 
252 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281104  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
252 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  43.55 
 
 
261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218659  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
255 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.74 
 
 
246 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.95 
 
 
247 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03260  conserved hypothetical protein  39.92 
 
 
554 aa  160  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
246 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5308  dehydrogenase  41.04 
 
 
256 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
262 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 
249 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.52 
 
 
250 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.52 
 
 
250 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
239 aa  159  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
246 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
254 aa  159  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  41.37 
 
 
255 aa  159  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  40.71 
 
 
263 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  40.71 
 
 
263 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>