More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0883 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  100 
 
 		 282 aa  570  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4881  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.06 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.53 
 
 		 252 aa  221  7e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  45.25 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.83 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.91 
 
 		 250 aa  212  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.15 
 
 		 248 aa  211  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.92 
 
 		 245 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.92 
 
 		 245 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.92 
 
 		 245 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.01 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.94 
 
 		 250 aa  202  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.15 
 
 		 250 aa  201  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.49 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.66 
 
 		 262 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.39 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201856  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.73 
 
 		 251 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.05 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 		 255 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0696546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.21 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.21 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  44.49 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 		 261 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3706  short chain dehydrogenase  42.7 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5514  cyclopentanol dehydrogenase  43.07 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.39 
 
 		 248 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 251 aa  186  5e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.69 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3720  short chain dehydrogenase  42.32 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0906259  normal  0.2081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2292  short chain dehydrogenase  41.95 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295109 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0875  short chain dehydrogenase  42.7 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0875261  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4559  short chain dehydrogenase  42.32 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5530  short chain dehydrogenase  42.32 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3804  short chain dehydrogenase  42.32 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.42 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.48 
 
 		 264 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.44 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.08 
 
 		 246 aa  182  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2217  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.53 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.545921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 		 244 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.51 
 
 		 259 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  41.22 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3121  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 263 aa  175  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1966  short chain dehydrogenase  40.6 
 
 		 262 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.783196 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1627  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2511  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0246  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0943  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2649  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0283  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.879782  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1430  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.42 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0524  short chain dehydrogenase  40.52 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.02 
 
 		 245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1174  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 257 aa  172  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0373  Short-chain alcohol dehydrogenase  38.26 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3543  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 		 250 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1576  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.44 
 
 		 268 aa  168  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 253 aa  168  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 248 aa  165  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.22 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.22 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.22 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 		 257 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612868  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.22 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  38.93 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0671  putative short-chain dehydrogenase/reductase  42.38 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.84 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>