More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7160 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
252 aa  507  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1174  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.79 
 
 
252 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7132  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
257 aa  242  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.928828  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.4 
 
 
251 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 
250 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 
251 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.85 
 
 
250 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
254 aa  205  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
244 aa  203  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.61 
 
 
248 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  46.9 
 
 
257 aa  198  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
246 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
248 aa  195  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
245 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
245 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
245 aa  191  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
262 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
246 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.91 
 
 
251 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
248 aa  181  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
253 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
257 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 
259 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
250 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
251 aa  177  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0875  short chain dehydrogenase  43.56 
 
 
259 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0875261  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
260 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 
252 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
256 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  44.18 
 
 
260 aa  175  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 
245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
245 aa  172  5e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  43.23 
 
 
282 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
256 aa  171  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
250 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.6 
 
 
246 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  43.15 
 
 
256 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.2 
 
 
249 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
256 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
252 aa  169  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.2 
 
 
246 aa  169  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 
251 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
258 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
274 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138252  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.76 
 
 
257 aa  169  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
269 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
250 aa  168  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
254 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3121  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
267 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
248 aa  168  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
250 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
245 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
250 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
256 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
255 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
258 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
261 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  42.02 
 
 
258 aa  165  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
253 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
257 aa  165  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  41.25 
 
 
261 aa  164  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  39.22 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17790  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.76 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.40467 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
252 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
255 aa  161  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
244 aa  161  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.806753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
281 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223454  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
254 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0940  putative short-chain dehydrogenase  38.72 
 
 
266 aa  161  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  42.7 
 
 
261 aa  161  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
252 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
246 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
253 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
251 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
270 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  41.11 
 
 
255 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
253 aa  160  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
250 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
261 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.43 
 
 
244 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
251 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
262 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
261 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5514  cyclopentanol dehydrogenase  38.64 
 
 
264 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>