More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2259 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2217  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.6 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.41 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.61 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3532  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  43.7 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  45.1 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 251 aa  195  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0875  short chain dehydrogenase  44.53 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0875261  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.61 
 
 		 268 aa  186  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1576  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.53 
 
 		 268 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.04 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0242  Short-chain alcohol dehydrogenase  39.6 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.54 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  43.8 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 		 250 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0671  putative short-chain dehydrogenase/reductase  42.91 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 		 245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 		 245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.545921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3706  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5530  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201856  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  44.66 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2292  short chain dehydrogenase  40.54 
 
 		 262 aa  168  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 		 252 aa  168  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 		 248 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3720  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0906259  normal  0.2081 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4559  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3804  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.17 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0696546 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2511  short chain dehydrogenase  40.71 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2649  short chain dehydrogenase  40.71 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0246  short chain dehydrogenase  40.71 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1627  short chain dehydrogenase  40.71 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0943  short chain dehydrogenase  40.71 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1430  short chain dehydrogenase  40.71 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0283  short chain dehydrogenase  40.71 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.879782  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0524  short chain dehydrogenase  40.55 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0769  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 		 553 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3121  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0373  Short-chain alcohol dehydrogenase  39.43 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.53 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 250 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  40.08 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1966  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.783196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7132  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.928828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 283 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.98 
 
 		 299 aa  152  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 245 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0441306  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3027  Short-chain dehydrogenase/reductase  41.47 
 
 		 259 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.730472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>