More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1576 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1576  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 		 268 aa  545  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29701  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0671  putative short-chain dehydrogenase/reductase  72.83 
 
 		 273 aa  358  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.57 
 
 		 273 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.4 
 
 		 259 aa  318  5e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.64 
 
 		 277 aa  305  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  44.23 
 
 		 258 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  44.87 
 
 		 257 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.25 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2217  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0875  short chain dehydrogenase  42.42 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0875261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.13 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  42.75 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  40.68 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.545921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2292  short chain dehydrogenase  40.68 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4559  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.8 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0696546 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3720  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0906259  normal  0.2081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3804  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  41.38 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.51 
 
 		 264 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3706  short chain dehydrogenase  40.68 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5530  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0373  Short-chain alcohol dehydrogenase  40.86 
 
 		 243 aa  171  9e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 250 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.04 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 256 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 		 260 aa  168  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  40.44 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3121  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 		 267 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0769  short chain dehydrogenase  42.08 
 
 		 553 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 		 277 aa  162  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0524  short chain dehydrogenase  39.47 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.13 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0246  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1430  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0943  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 265 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0242  Short-chain alcohol dehydrogenase  36.4 
 
 		 253 aa  159  6e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0283  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.879782  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2511  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 267 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2649  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1627  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 		 248 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  40 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7132  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.928828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2249  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113674  decreased coverage  1.89116e-19 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.15 
 
 		 246 aa  155  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.89 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.77 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 251 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 249 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>