More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2813 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
251 aa  511  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 
253 aa  255  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.03 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 
251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
244 aa  234  8e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.41 
 
 
251 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.79 
 
 
245 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.79 
 
 
245 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.79 
 
 
245 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.76 
 
 
244 aa  222  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  51.44 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.98 
 
 
248 aa  218  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
248 aa  218  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.58 
 
 
253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
264 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
250 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.5 
 
 
260 aa  209  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
248 aa  208  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 
252 aa  205  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 
253 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2249  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113674  decreased coverage  1.89116e-19 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
251 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
260 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
254 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
248 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
249 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.27 
 
 
249 aa  184  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.57 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
282 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
282 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
251 aa  181  8.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
254 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
245 aa  180  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
246 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
246 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
250 aa  178  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
254 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
245 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.89 
 
 
247 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 
268 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.8 
 
 
246 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
255 aa  175  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0373  Short-chain alcohol dehydrogenase  42.34 
 
 
243 aa  175  8e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2217  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
280 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.45 
 
 
249 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
246 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
251 aa  169  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
276 aa  168  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
257 aa  168  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
250 aa  168  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
246 aa  168  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.64 
 
 
246 aa  168  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.93 
 
 
246 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
255 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
250 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  40.54 
 
 
257 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
246 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
252 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
252 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  40.55 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  42.59 
 
 
282 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.24 
 
 
246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.75 
 
 
244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.57 
 
 
246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.57 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1472  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  41.2 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0273044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.39 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0400117  normal  0.51074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
255 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
255 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0594  putative short-chain type dehydrogenase  43.5 
 
 
252 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.722821  normal  0.132881 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
273 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00507131  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.18 
 
 
246 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.56 
 
 
239 aa  160  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1174  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
252 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 
246 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7132  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
257 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.928828  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
252 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.52 
 
 
246 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
249 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
280 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
280 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.11 
 
 
246 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>