More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3667 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
259 aa  510  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.54 
 
 
258 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.98 
 
 
264 aa  280  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.55 
 
 
261 aa  257  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.8 
 
 
251 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.69 
 
 
253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.2 
 
 
251 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.65 
 
 
244 aa  249  4e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.36 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2249  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
260 aa  242  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113674  decreased coverage  1.89116e-19 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.71 
 
 
176 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.406205  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 
252 aa  231  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.41 
 
 
245 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
245 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.03 
 
 
251 aa  229  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
245 aa  229  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 
250 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 
248 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
248 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
260 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.17 
 
 
253 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
249 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.98 
 
 
244 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 
248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
260 aa  204  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  49.21 
 
 
260 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
251 aa  203  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
251 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.18 
 
 
254 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 
245 aa  188  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 
248 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
250 aa  185  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138252  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.39 
 
 
249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 
246 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.88 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  43.92 
 
 
258 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
255 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7132  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
257 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.928828  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
260 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  41.31 
 
 
259 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.87 
 
 
262 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  41.31 
 
 
259 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  41.31 
 
 
259 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.82 
 
 
247 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  41.31 
 
 
259 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.63 
 
 
261 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 
269 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  41.27 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
255 aa  178  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
255 aa  178  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
251 aa  177  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
250 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  40.87 
 
 
260 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  40.87 
 
 
260 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
262 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
245 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.679351  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.78 
 
 
249 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 
259 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.49 
 
 
246 aa  175  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  42.29 
 
 
261 aa  175  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.5 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  41.5 
 
 
259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0545  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.074184  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.55 
 
 
246 aa  172  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  40.55 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.55 
 
 
246 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
255 aa  171  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 
269 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0521  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 
260 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847891  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
280 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
260 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
245 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
265 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
260 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1174  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
252 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252044 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  43.03 
 
 
251 aa  169  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
246 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0620  putative short-chain dehydrogenase/reductase  44.31 
 
 
277 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
271 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  43.51 
 
 
282 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
263 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
249 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
282 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
246 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.57 
 
 
271 aa  168  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
254 aa  168  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
282 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>