More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2023 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.58 
 
 
240 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0400117  normal  0.51074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
240 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
240 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.25 
 
 
243 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218659  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.25 
 
 
243 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0160173  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 
248 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.87 
 
 
253 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
253 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
245 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
259 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
248 aa  165  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
248 aa  164  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
251 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
251 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 
244 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
251 aa  160  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 
262 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.93 
 
 
261 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  42.37 
 
 
260 aa  159  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 
262 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 
258 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
264 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  37.4 
 
 
258 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 
260 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0523  acetoin reductase  36.61 
 
 
254 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0841243  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.1 
 
 
266 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2249  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
260 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113674  decreased coverage  1.89116e-19 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
260 aa  151  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0693  acetoin reductase  36.58 
 
 
259 aa  151  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0373787  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
250 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
262 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
250 aa  149  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
251 aa  148  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
250 aa  148  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  34.78 
 
 
253 aa  148  9e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  36.61 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
251 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  35.69 
 
 
258 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
248 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  35.69 
 
 
258 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7132  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
257 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.928828  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  36.82 
 
 
256 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
247 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.585241  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
253 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
244 aa  143  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
250 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  36.22 
 
 
257 aa  142  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
262 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
248 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0136754  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
257 aa  141  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17790  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.52 
 
 
288 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.40467 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  39.02 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.93 
 
 
247 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2853  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  36.89 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  36.8 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
248 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  36.61 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1174  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
254 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
254 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
282 aa  138  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  36.22 
 
 
257 aa  138  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
250 aa  138  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  41.74 
 
 
255 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4004  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
259 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
249 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
286 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000174886  normal  0.399546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
274 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138252  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
263 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
250 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
251 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
250 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
265 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
246 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
263 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.29 
 
 
258 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
247 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
245 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4137  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.29 
 
 
258 aa  135  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 
250 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
269 aa  135  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.17 
 
 
248 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.33 
 
 
258 aa  135  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
263 aa  135  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  39.75 
 
 
260 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>