More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1767 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
246 aa  482  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58 
 
 
250 aa  265  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
249 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.8 
 
 
251 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17790  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  45.78 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.40467 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
251 aa  211  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 
250 aa  209  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  45.35 
 
 
257 aa  208  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
251 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
255 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 
252 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
255 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.1 
 
 
268 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.7 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
244 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  48.63 
 
 
261 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
259 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.37 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
253 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.37 
 
 
246 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
252 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
256 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
248 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
248 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
253 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.9 
 
 
249 aa  185  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  44.09 
 
 
261 aa  185  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1174  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
252 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  39.92 
 
 
247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  45.08 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
247 aa  182  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
251 aa  179  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.21 
 
 
245 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
247 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  45.38 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
264 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
245 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
245 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
248 aa  179  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  39.68 
 
 
247 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 
254 aa  178  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
250 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0875  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
259 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0875261  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.89 
 
 
250 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
260 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  39.68 
 
 
259 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
251 aa  176  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
256 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
249 aa  176  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
249 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
239 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
255 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
246 aa  174  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  40.15 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138252  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
269 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
257 aa  172  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.34144  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 
253 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
251 aa  171  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  42.91 
 
 
256 aa  171  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
250 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
257 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000368197  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
251 aa  171  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
246 aa  171  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3121  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.29 
 
 
267 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
252 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
265 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.41 
 
 
249 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
250 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
246 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5514  cyclopentanol dehydrogenase  40.68 
 
 
264 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
256 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
244 aa  169  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  40 
 
 
249 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
256 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28835 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
245 aa  168  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
258 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7132  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
257 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.928828  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
252 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
260 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
252 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
250 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
262 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00696289  normal  0.955731 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
251 aa  164  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>