More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17790 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_17790  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  100 
 
 
288 aa  584  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.40467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.64 
 
 
249 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17570  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  65.58 
 
 
238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
250 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
246 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
251 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
250 aa  178  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
250 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
244 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
250 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
251 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
268 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
252 aa  169  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
252 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 
255 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
248 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
253 aa  165  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.89 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1174  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
250 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
254 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
298 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
257 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
256 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
250 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
249 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.58 
 
 
252 aa  159  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
252 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
264 aa  159  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  39.77 
 
 
257 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
274 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138252  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
283 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
251 aa  155  6e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
251 aa  155  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  38.28 
 
 
254 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 
259 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
256 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5514  cyclopentanol dehydrogenase  38.4 
 
 
264 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
256 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
249 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
255 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
255 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
257 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
257 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
257 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3121  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
267 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.65 
 
 
256 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000927245  normal  0.0200652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
244 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
256 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
260 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
252 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
277 aa  149  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0429275  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
260 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 
257 aa  148  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  38.37 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
260 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
246 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
253 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
248 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  34.9 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
239 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
252 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
250 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
253 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
263 aa  145  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
245 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
258 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
245 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
250 aa  145  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
246 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 
246 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
246 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  37.11 
 
 
258 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
252 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
262 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 
265 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
286 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000174886  normal  0.399546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.9 
 
 
264 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  38.96 
 
 
260 aa  143  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
282 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.9 
 
 
264 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.9 
 
 
264 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.33 
 
 
246 aa  142  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 
258 aa  142  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
255 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0696546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
263 aa  142  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>