More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1545 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 254 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72 
 
 		 255 aa  354  5.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.6 
 
 		 252 aa  348  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.03 
 
 		 254 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2217  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  45.45 
 
 		 257 aa  218  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3532  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 		 253 aa  209  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  45.02 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  42.52 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0875  short chain dehydrogenase  42.02 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0875261  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 		 251 aa  178  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0373  Short-chain alcohol dehydrogenase  40.65 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 250 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 		 261 aa  171  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0242  Short-chain alcohol dehydrogenase  37.2 
 
 		 253 aa  171  9e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1576  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.29 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29701  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4559  short chain dehydrogenase  41.02 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3720  short chain dehydrogenase  41.02 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0906259  normal  0.2081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3804  short chain dehydrogenase  41.02 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  40.62 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.545921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2292  short chain dehydrogenase  40.62 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67028  normal  0.072064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5530  short chain dehydrogenase  40.62 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3706  short chain dehydrogenase  40.62 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1627  short chain dehydrogenase  41.34 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2649  short chain dehydrogenase  41.34 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0283  short chain dehydrogenase  41.34 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.879782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  41.22 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0246  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0943  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2511  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1430  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0696546 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0671  putative short-chain dehydrogenase/reductase  41.18 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0524  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 		 263 aa  161  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201856  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  41.06 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 251 aa  158  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5514  cyclopentanol dehydrogenase  37.55 
 
 		 264 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1966  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.783196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 		 251 aa  149  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 		 251 aa  149  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  37.55 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.04 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2249  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000113674  decreased coverage  1.89116e-19 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00370  fatty acid beta-oxidation-related protein, putative  37.88 
 
 		 292 aa  142  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.170907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>