More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0123 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 273 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0671  putative short-chain dehydrogenase/reductase  81.68 
 
 		 273 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1576  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  70.57 
 
 		 268 aa  358  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.29701  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.3 
 
 		 259 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.08 
 
 		 277 aa  301  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  45.63 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 		 251 aa  194  9e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 252 aa  186  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1552  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 		 255 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1514  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  42.53 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0242  Short-chain alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0373  Short-chain alcohol dehydrogenase  40.15 
 
 		 243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161777  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 254 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2292  short chain dehydrogenase  41.51 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295109 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  39.62 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3720  short chain dehydrogenase  40.38 
 
 		 262 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0906259  normal  0.2081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2217  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4559  short chain dehydrogenase  40.38 
 
 		 262 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3804  short chain dehydrogenase  40.38 
 
 		 262 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 251 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.89 
 
 		 264 aa  175  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3706  short chain dehydrogenase  40.75 
 
 		 262 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0875  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0875261  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5530  short chain dehydrogenase  40.75 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  39.31 
 
 		 262 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.545921 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.18 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201856  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 		 261 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  41.64 
 
 		 282 aa  169  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0524  short chain dehydrogenase  39.54 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.29 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.15 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.13 
 
 		 248 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2649  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1627  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0283  short chain dehydrogenase  39.62 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.879782  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0246  short chain dehydrogenase  39.69 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0943  short chain dehydrogenase  39.69 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1430  short chain dehydrogenase  39.69 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.15 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2511  short chain dehydrogenase  39.69 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3121  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 248 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0696546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 		 253 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 		 261 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 263 aa  158  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 		 245 aa  158  8e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0769  short chain dehydrogenase  41.6 
 
 		 553 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.55 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7132  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.928828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.94 
 
 		 245 aa  156  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  40.3 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 		 269 aa  155  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 250 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12034  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase fabG3  39.39 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.92 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>